在人類已經衰落的遙遠未來。 舊日繁盛的文明因災難和戰爭而覆滅,大地上植物滅絕、生態崩壞。在人類最後的城市——海汶斯威爾,僅存的人們因「凈地」的傳說聚集而來,徘徊於城壁內外,茍延殘喘。 與此同時,一種被稱為「原漿」的黑色漿液從地下湧現,很快便蔓延至城市的各個角落,而從中誕生的怪物們開始四處作亂,蠶食著人們的生存空間。
在超越了想象的力量面前,人們忿恨於自身的孱弱,卻無力反抗……他們茍活於城市的夾縫,等待著毀滅。 絕境之下,一群被稱為「機兵」的少年少女出現在海汶城,為局勢帶來了一絲轉機。「機兵」有著人類的外表,卻是以未知的技術創造的全新生命。他們各自懷揣使命,開始了孤獨而危險的旅程。